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如果可以保證自己發酵的乳酸菌可以達到水平，發酵酸奶的菌種也不被細菌污染這種問題的話就是安全的。自己做酸奶要想達到安全食用的水平，要注意很多事項。

自制酸奶的基本原理就是：在牛奶中接種乳酸菌，讓它在合適的溫度（常用42℃-45℃）下大量繁殖。在乳酸的作用下，牛奶發酵液的酸度會逐漸下降，當pH值大致達到4.6左右的時候，奶中的酪蛋白就會緩慢地沉降下來，形成細膩的凝凍。

這個步驟中，42℃-45℃的溫度在家就很難把握和實現，因此在發酵乳酸菌過程中很容易就會產生大量的細菌。

從菌種上來說，自己買的發酵菌種沒有安全保障，網購的凍干菌種在運輸過程中，又會受到溫度等因素影響，很容易就失去活性。有些人會選擇喝剩的酸奶作為引子來接種，可是接種是需要在無菌的情況下進行，家里沒有這個條件。

想要在家制作酸奶就需要買一個專業的儀器，使用的原料奶和與其接觸的所有用具包括發酵容器和攪拌用具等，都要經過煮沸或熱燙滅菌處理。在選擇菌種的時候，盡量選擇單一的菌種保證健康和安全。